平成29年5月1日付にて、むかいじま病院は公益社団法人日本理学療法士協会の生涯学習制度の臨床指導施設として認定されました。この認定を得ている施設は京都府では5施設のみです。当院リハビリテーション科は
神経専門理学療法士、基礎専門理学療法士、生活環境支援専門理学療法士が在籍しており、運動器疾患や脳血管疾患、パーキンソン病について近隣病院などの理学療法士に対して臨床指導を行うことができます。
また、当院は回復期リハビリテーション病棟を有しており、切れ目のない在宅復帰にむけた生活環境支援（福祉用具や住宅改修、各種制度）として訪問看護や訪問リハビリなどの介護保険サービスへの連携ついて経験を積むことができます。質の高いリハビリテーションを提供するために学術活動も積極的に行っています。

最近の学会発表の一例

・World Confederation for Physical Therapy Congress in Singapore
・The 15th Scientific Meeting of Korea - Japan Health Education Symposium in Korea
・日本リハビリテーション医学会学術大会（京都府）
・日本理学療法学術大会（千葉県）
・日本作業療法学会（北海道）など計50演題以上発表

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